Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CAPGP40121 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CAPGP40121 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CAPGP40121 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CAPGP40121 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CAPGP40121 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CAPGP40121 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CAPGP40121 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms