Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RPL3P39023 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPL3P39023 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL3P39023 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL3P39023 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL3P39023 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL3P39023 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL3P39023 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL3P39023 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL3P39023 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL3P39023 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms