Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
BMI1P35226 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
BMI1P35226 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms