Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC8A1P32418 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC8A1P32418 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms