Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD34P28906 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CD34P28906 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD34P28906 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD34P28906 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD34P28906 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD34P28906 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD34P28906 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD34P28906 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD34P28906 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD34P28906 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms