Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DUSP1P28562 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DUSP1P28562 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms