Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ABCD3P28288 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ABCD3P28288 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms