Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C4BPBP20851 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
C4BPBP20851 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms