Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HLA-DPA1P20036 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HLA-DPA1P20036 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms