Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRT15P19012 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KRT15P19012 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRT15P19012 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRT15P19012 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KRT15P19012 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms