Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCLP18206 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCLP18206 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCLP18206 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCLP18206 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCLP18206 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
VCLP18206 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
VCLP18206 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
VCLP18206 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VCLP18206 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms