Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB2P17787 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB2P17787 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms