Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RARBP10826 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RARBP10826 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RARBP10826 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RARBP10826 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARBP10826 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARBP10826 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARBP10826 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RARBP10826 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RARBP10826 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RARBP10826 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RARBP10826 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RARBP10826 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARBP10826 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARBP10826 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms