Protein–RNA interactions for Protein: P04424

ASL, Argininosuccinate lyase, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASLP04424 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ASLP04424 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ASLP04424 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ASLP04424 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ASLP04424 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ASLP04424 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ASLP04424 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ASLP04424 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASLP04424 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ASLP04424 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ASLP04424 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ASLP04424 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ASLP04424 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms