Protein–RNA interactions for Protein: P01599

IGKV1-17, Immunoglobulin kappa variable 1-17, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-17P01599 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IGKV1-17P01599 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
IGKV1-17P01599 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms