Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRD1O95696 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD1O95696 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRD1O95696 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BRD1O95696 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BRD1O95696 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BRD1O95696 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BRD1O95696 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD1O95696 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD1O95696 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BRD1O95696 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD1O95696 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD1O95696 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD1O95696 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD1O95696 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BRD1O95696 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms