Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SFT2D2O95562 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFT2D2O95562 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms