Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRAMEF1O95521 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRAMEF1O95521 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms