Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM63AO94886 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM63AO94886 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms