Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNTN5O94779 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNTN5O94779 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms