Protein–RNA interactions for Protein: O76090

BEST1, Bestrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST1O76090 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BEST1O76090 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BEST1O76090 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BEST1O76090 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BEST1O76090 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BEST1O76090 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BEST1O76090 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BEST1O76090 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms