Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BBOX1O75936 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BBOX1O75936 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms