Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
RPS6KA4O75676 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPS6KA4O75676 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPS6KA4O75676 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms