Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TULP3O75386 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TULP3O75386 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TULP3O75386 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP3O75386 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP3O75386 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP3O75386 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TULP3O75386 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TULP3O75386 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP3O75386 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP3O75386 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP3O75386 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TULP3O75386 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TULP3O75386 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TULP3O75386 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms