Protein–RNA interactions for Protein: O75339

CILP, Cartilage intermediate layer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CILPO75339 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CILPO75339 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CILPO75339 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CILPO75339 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CILPO75339 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CILPO75339 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CILPO75339 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CILPO75339 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CILPO75339 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CILPO75339 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CILPO75339 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms