Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KLHL41O60662 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL41O60662 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL41O60662 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL41O60662 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KLHL41O60662 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KLHL41O60662 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KLHL41O60662 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
KLHL41O60662 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KLHL41O60662 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLHL41O60662 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms