Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CEP104O60308 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP104O60308 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP104O60308 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP104O60308 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CEP104O60308 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms