Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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PDE6DO43924 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PDE6DO43924 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
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PDE6DO43924 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDE6DO43924 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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PDE6DO43924 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PDE6DO43924 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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