Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN3O15551 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN3O15551 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms