Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 54 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
J3QR89 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
J3QR89 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
J3QR89 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
J3QR89 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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J3QR89 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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J3QR89 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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J3QR89 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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J3QR89 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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J3QR89 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
J3QR89 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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J3QR89 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
J3QR89 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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