Protein–RNA interactions for Protein: J3KT08

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KT08 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
J3KT08 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
J3KT08 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
J3KT08 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3KT08 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3KT08 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3KT08 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3KT08 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms