Protein–RNA interactions for Protein: F8VRH5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VRH5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
F8VRH5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
F8VRH5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
F8VRH5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
F8VRH5 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
F8VRH5 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
F8VRH5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms