Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
B4DXG7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
B4DXG7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
B4DXG7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
B4DXG7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
B4DXG7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
B4DXG7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
B4DXG7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
B4DXG7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms