Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VGLL3A8MV65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VGLL3A8MV65 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms