Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP27XA6NNY8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP27XA6NNY8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP27XA6NNY8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms