Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms