Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TRAPPC1Q9Y5R8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAPPC1Q9Y5R8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAPPC1Q9Y5R8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAPPC1Q9Y5R8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms