Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAXBP1Q9Y5B6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAXBP1Q9Y5B6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAXBP1Q9Y5B6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
PAXBP1Q9Y5B6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PAXBP1Q9Y5B6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PAXBP1Q9Y5B6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PAXBP1Q9Y5B6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PAXBP1Q9Y5B6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms