Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y587

AP4S1, AP-4 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4S1Q9Y587 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
AP4S1Q9Y587 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
AP4S1Q9Y587 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
AP4S1Q9Y587 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP4S1Q9Y587 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP4S1Q9Y587 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AP4S1Q9Y587 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AP4S1Q9Y587 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AP4S1Q9Y587 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AP4S1Q9Y587 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms