Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAB39Q9Y376 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAB39Q9Y376 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAB39Q9Y376 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAB39Q9Y376 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAB39Q9Y376 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAB39Q9Y376 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAB39Q9Y376 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAB39Q9Y376 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAB39Q9Y376 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms