Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSR3Q9UNL2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSR3Q9UNL2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSR3Q9UNL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SSR3Q9UNL2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SSR3Q9UNL2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSR3Q9UNL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSR3Q9UNL2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SSR3Q9UNL2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms