Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP17Q9ULZ9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP17Q9ULZ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP17Q9ULZ9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.55■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP17Q9ULZ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MMP17Q9ULZ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP17Q9ULZ9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP17Q9ULZ9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP17Q9ULZ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP17Q9ULZ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms