Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT8

HECTD1, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD1, humanhuman

Predictions only

Length 2,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD1Q9ULT8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HECTD1Q9ULT8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HECTD1Q9ULT8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HECTD1Q9ULT8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HECTD1Q9ULT8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HECTD1Q9ULT8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HECTD1Q9ULT8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HECTD1Q9ULT8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECTD1Q9ULT8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HECTD1Q9ULT8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HECTD1Q9ULT8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms