Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CASP8AP2Q9UKL3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CASP8AP2Q9UKL3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CASP8AP2Q9UKL3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
CASP8AP2Q9UKL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CASP8AP2Q9UKL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CASP8AP2Q9UKL3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
CASP8AP2Q9UKL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CASP8AP2Q9UKL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CASP8AP2Q9UKL3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.7■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CASP8AP2Q9UKL3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
CASP8AP2Q9UKL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CASP8AP2Q9UKL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms