Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0Z9

PIPOX, Peroxisomal sarcosine oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOXQ9P0Z9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PIPOXQ9P0Z9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PIPOXQ9P0Z9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PIPOXQ9P0Z9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PIPOXQ9P0Z9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PIPOXQ9P0Z9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PIPOXQ9P0Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIPOXQ9P0Z9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms