Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NDUFA13Q9P0J0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NDUFA13Q9P0J0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NDUFA13Q9P0J0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NDUFA13Q9P0J0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NDUFA13Q9P0J0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NDUFA13Q9P0J0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms