Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ43

USE1, Vesicle transport protein USE1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USE1Q9NZ43 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USE1Q9NZ43 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USE1Q9NZ43 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USE1Q9NZ43 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
USE1Q9NZ43 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USE1Q9NZ43 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USE1Q9NZ43 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
USE1Q9NZ43 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USE1Q9NZ43 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USE1Q9NZ43 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USE1Q9NZ43 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms