Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU23

LYRM2, LYR motif-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM2Q9NU23 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM2Q9NU23 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYRM2Q9NU23 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LYRM2Q9NU23 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LYRM2Q9NU23 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LYRM2Q9NU23 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LYRM2Q9NU23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LYRM2Q9NU23 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
LYRM2Q9NU23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LYRM2Q9NU23 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LYRM2Q9NU23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms