Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNB1IP1Q9NPC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCNB1IP1Q9NPC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCNB1IP1Q9NPC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNB1IP1Q9NPC3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNB1IP1Q9NPC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms