Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN2

TP53AIP1, p53-regulated apoptosis-inducing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53AIP1Q9HCN2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TP53AIP1Q9HCN2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TP53AIP1Q9HCN2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TP53AIP1Q9HCN2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TP53AIP1Q9HCN2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TP53AIP1Q9HCN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TP53AIP1Q9HCN2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms